Es probable que un archivo con la extensión de archivo PDB sea un archivo creado en el formato de base de datos del programa que se utiliza para contener información de depuración sobre un programa o módulo, como un archivo DLL o EXE. A veces se les llama archivos de símbolos.
Los archivos PDB asignan varios componentes e instrucciones en un código fuente a su producto final compilado, que el depurador puede usar para encontrar el archivo fuente y la ubicación en el ejecutable en el que debe detener el proceso de depuración.
Algunos archivos PDB podrían estar en el formato de archivo del Banco de datos de proteínas. Estos archivos PDB son archivos de texto sin formato que almacenan coordenadas con respecto a estructuras de proteínas.
Es probable que otros archivos PDB se creen en el formato de base de datos Palm o PalmDOC y se usen con el sistema operativo móvil PalmOS. Algunos archivos en este formato usan la extensión de archivo .PRC en su lugar.
Cómo abrir un archivo PDB
Diferentes programas utilizan su propio archivo PDB para almacenar datos en algún tipo de formato de base de datos estructurada, por lo que cada aplicación se utiliza para abrir su propio tipo de archivo PDB. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio y Pegasus son solo algunos ejemplos de programas que pueden usar un archivo PDB como archivo de base de datos. Radare y PDBparse también pueden funcionar para abrir archivos PDB.
Algunos archivos PDB se almacenan como texto sin formato, como los archivos de la base de datos de depuración del programa de Geneious, y son completamente legibles para los humanos si se abren en un editor de texto. Puede abrir este tipo de archivo PDB con cualquier programa que pueda leer documentos de texto, como el programa Bloc de notas incorporado en Windows. Algunos otros visores y editores de archivos PDB incluyen Notepad ++ y corchetes.
Otros archivos de base de datos de PDB no son documentos de texto y solo son útiles cuando se abren con el programa para el que están diseñados. Por ejemplo, si su archivo PDB está relacionado de alguna manera con Quicken, intente usar ese software para ver o editar el archivo PDB. Visual Studio espera ver un archivo PDB en la misma carpeta que el archivo DLL o EXE.
Puede ver y editar archivos PDB que son archivos de Protein Data Bank, en Windows, Linux y macOS con Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB y USCF Chimera también pueden abrir un archivo PDB. Dado que estos archivos son de texto plano, también puede abrir el archivo PDB en un editor de texto.
Palm Desktop debería poder abrir archivos PDB que estén en el formato de archivo de la base de datos Palm, pero es posible que primero tenga que cambiarle el nombre para tener la extensión de archivo .PRC para que ese programa lo reconozca. Para abrir un archivo PDB de PalmDOC, intente STDU Viewer.
Cómo convertir un archivo PDB
Es probable que los archivos de la base de datos del programa no puedan convertirse a un formato de archivo diferente, al menos no con una herramienta de conversión de archivos normal. En cambio, si hay alguna herramienta que pueda convertir este tipo de archivo PDB, sería el mismo programa que puede abrirlo.
Por ejemplo, si necesita convertir su archivo de base de datos PDB de Quicken, intente usar ese programa para hacerlo. Sin embargo, este tipo de conversión probablemente no solo es de poca utilidad sino que tampoco es compatible con estas aplicaciones de base de datos (es decir, es probable que no necesite convertir este tipo de archivo PDB a ningún otro formato).
Los archivos de Protein Data Bank se pueden convertir a otros formatos con MeshLab. Para hacer esto, es posible que primero tenga que convertir el archivo PDB a WRL con PyMOL desde el Archivo> Guardar imagen como> VRML menú, y luego importe el archivo WRL en MeshLab y use el Archivo> Exportar malla como Menú para convertir finalmente el archivo PDB a STL u otro formato de archivo.
Si no necesita que el modelo esté en color, puede exportar el archivo PDB directamente a STL con USCF Chimera (el enlace de descarga está arriba). De lo contrario, puede usar el mismo método anterior (con MeshLab) para convertir PDB a WRL con USCF Chimera y luego exportar el archivo WRL a STL con MeshLab.
Para convertir PDB a PDF o EPUB, si tiene un archivo PalmDOC, es posible de varias maneras, pero lo más fácil es probablemente usar un convertidor de PDB en línea como Zamzar. Puede cargar su archivo PDB en ese sitio web para tener la opción de convertirlo a esos formatos, así como a AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT y otros formatos de archivos de libros electrónicos.
Para convertir el archivo PDB al formato FASTA se puede hacer con el PDB en línea de Meiler Lab al convertidor FASTA.
También es posible convertir PDB a CIF (formato de información cristalográfica) en línea usando PDBx / mmCIF.
Lectura avanzada en archivos PDB
Puede leer mucho más sobre los archivos de la base de datos de programas de Microsoft, GitHub y Wintellect.
También hay más que aprender acerca de los archivos de Protein Data Bank; Ver Worldwide Protein Data Bank y RCSB PDB.
¿Su archivo aún no se abre?
Los archivos PDB que no se abren con ninguna de las herramientas anteriores, probablemente no sean realmente archivos PDB. Lo que podría estar sucediendo es que estás malinterpretando la extensión del archivo; algunos formatos de archivo usan un sufijo que se parece mucho a ".PDB" cuando realmente no están relacionados y no funcionan de la misma manera.
Por ejemplo, un archivo PDF es un archivo de documento, pero la mayoría de los programas anteriores no procesarán el texto o las imágenes correctamente si intenta abrir uno con estos programas de software. Lo mismo se aplica a otros archivos con extensiones de archivos deletreadas de manera similar, como los archivos PD, PDE, PDC y PDO.
PBD es otro que pertenece al programa EaseUS Todo Backup y, por lo tanto, solo es útil cuando se abre con ese software.
Si no tiene un archivo PDB, busque la extensión de archivo que tiene su archivo para poder encontrar el programa apropiado que lo abra o lo convierta.
